为何要阐明“阴阳系统论”？
从中医发展的两千年历史可以看出，《内经》和《伤寒杂病论》之后，中医理论就没有被明确的阐明过，医家都以各自的理解来说明这个理论，以至于流派纷争，莫衷一是。可以说完整的中医理论体系已经失传。
现代科学和医学的发展，为重整中医理论体系提供了良好的契机。由于现代系统论的出现，使中医理论的现代科学解读和阐述成为了可能。我们虽不知中医理论全部，但其思想方法还是可以体会的，这个认识论和方法论体系的基本概念和方法还是可以被理解的。因此，用系统的概念阐明中医理论就事在必行了。阴阳系统论旨在阐明古代中国的科学思想体系，他是古代中国人思想和行为的基本出发点，这个问题不说清楚，古代的一切神秘奇迹就无从破解，中医这个宝贝老古董的正真价值就无从被了解和挖掘。
中医的理法方药与现代科学认识方式和研究方法是如此的不同，以至于一些高级科学工作者也不能理解，原因何在呢？首先是中医界自己也拿不出一套像样的有科学说服力的完整理论，于是别人就必然认为中医缺乏正真的理论，是经验医学。另一方面，中医理论的体系结构建立在一个完全不同于现代科学的认识论和方法论之上，以现代科学的思维方式来理解中医显然百思不得其解。
因此，要想使中医让人理解，必须阐明他的认识和方法体系；要想使中医现代化，必须整理出一套完整的认识和方法体系；要想使中医摆脱模糊的解释状态，必须建立一套严格精确的理论描述方式；要想使中医正真的继承，我们必须深刻而精确的理解这套理论；要想正真的发展中医，绝不能缺少这个理论基础。这一切的一切，都必将指向一个目标：整理并建立中医的现代基础理论体系，那就是：以阴阳系统论为指导的人体生理，病理，药理，诊断等，所谓理法方药体系！
这个理论可以完全的解释所有中医的理法方药，这个理论绝不会与现代的科学常识与成就相矛盾，这个理论无论是中医学者，西医学者乃至一切现代科学工作者，普通百姓都可以理解，都可以掌握。阴阳系统论必将为我们打开一扇通向智慧的大门！